Yalnız biri olan inatçı Snake Eyes, veliahtlarını kurtardıktan sonra, Eski Japon klanı olan Arashikage'e kabul edilir ve burada ninja savaşçısının yollarını öğrenir. Ancak geçmişinden gelen sırlar ortaya çıktığında, Snake Eyes'ın onuru ve bağlılığı sınanacaktır - en yakınındakilerin güvenini kaybetmek anlamına gelse bile. Bu sınavda, Snake Eyes geçmişiyle yüzleşirken, içindeki çatışmayı aşmak zorunda kalır ve Arashikage klanının güvenini yeniden kazanmak için büyük bir mücadeleye girişir. Aynı zamanda, onun içsel yolculuğu ve ninja savaşçısı olarak kendini bulma çabası, onu güçlü bir savaşçıya ve sadık bir müttefike dönüştürür.
