Dünyadaki yeni hayatına alışmaya başlayan ve sadık dostu Tom ile güzel vakitler geçiren Sonic’in neşesi yine yarım kalacaktır. Çünkü Dr. Robotnik bu defa da rahat durmayacak ve dünya gezegenini yok etmek için elinden geleni ardına koymayacaktır. Fakat Dr. Robotnik’in korkunç planları karşısında yine Sonic ve Tom duracak ve doktora dünyayı dar edeceklerdir. Bu sefer ki bölümün farkı ise Dr. Robotnik’in planlarının bu sefer daha da korkunç ve detaylıca hazırlanmış olmasıdır. Bu sefer Dr. Robotnik işini şansa bırakmak yerine korkunç zekasına bırakmaya karar verir ve korkunç planlarını Sonic ve Tom’a rağmen devreye sokar!
