Film,Jones'un babası Profesör Henry Jones Sr.'ın kaybolmasıyla başlar. Henry, Kutsal Kase'nin peşindeyken Nazi ajanları tarafından kaçırılmıştır. Indiana Jones, babasını kurtarmak ve Kutsal Kase'nin gücünü Nazi Almanyası'nın elinden almak için bir kez daha harekete geçer. Jones, babasıyla birlikte Kutsal Kase'nin izini sürerken, tarihi ipuçları, gizemli tüneller ve tuzaklarla dolu bir yolculuğa çıkarlar. Bu yolculuk sırasında baba ve oğul hem aile bağlarını güçlendirmek hem de Kutsal Kase'nin sırlarını çözmek zorunda kalır. Film, arkeoloji, tarih ve mitolojiyi bir araya getirerek, izleyicilere tarihi ve bilimsel gizemlerle dolu bir macera sunar. Ayrıca, aile bağları, inanç, fedakarlık ve özgürlük gibi derin temaları işler.
