Eniştesi ve teyzesi ile geçirdiği tatsız bir yaz tatilinin ardından Harry, yaşının da ilerlemesinden dolayı onların kötü davranışlarına eskisi gibi göz yummamaktadır. Bir yaz gecesi Dursley’lerin evine ziyarete gelen Marge halaya büyü yapıp onu bir balona çeviren Harry, bunun ardından evden kaçar. Okulun sınırları harici büyü yapmasının yasak olduğunu bilse de, ceza almayacağını öğrenen Harry buna çok şaşırır. “Hızır Otobüs” sayesinde garip bir yolculuk ile Diagon Yolu’na giden Harry; tehlikeli bir suçlu olan Sirius Black’in Azkaban Hapishanesi’nden kaçtığını ve intikam alabilmek için kendisini öldürmek istediğini öğrenir. Aynı zamanda Hapishane’nin koruyucusu olan Ruh Emiciler’in etrafa tehlike saçtığının farkında olan Harry, kendisini koruyabilmek için Patronus büyüsünü yeni öğretmeni olan Lupin’den öğrenmeye başlar. Bu sırada birçok kişi hakkında büyük sırlar öğrenecektir.