CIA Direktörü Hunley (Baldwin'in canlandırdığı) yüksek riskli bir siyasi manevrayla bir Senato komitesini, Ethan Hunt'ın (Cruise tarafından canlandırılan) uzun süredir içinde yer aldığı elit bir gizli operasyon birimi olan IMF'yi (İmkansız Görev Gücü) dağıtmaya başarıyla ikna etti. Hunley'in argümanı, IMF'nin operasyonlarının pervasızlık ve hesap verme eksikliği ile karakterize edildiği fikrine dayanıyor. Artık IMF'nin resmen dağıtılmasıyla birlikte Hunt kendisini tamamen yeni ve meşum bir meydan okumayla karşı karşıya buluyor. Dikkati, gölgelerde faaliyet gösteren, küresel ölçekte olayları manipüle eden, Sendika olarak bilinen esrarengiz ve kötü niyetli haydut örgüte doğru kayıyor.