On yedi gemi Odo Adası yakınlarında patlayıp battığında, Profesör Kyohei Yamane, kızı Emiko Yamane ve deniz biyoloğu Hideto Ogata, olayları araştırmak için bir keşif gezisine çıkar. Adada yerli halk tarafından Gojira olarak bilinen devasa bir yaratığın yıkıcı gücüne tanıklık ederler. Bu sırada Emiko, oksijenle ilgili gizli bir keşfi ona emanet eden erkek arkadaşı münzevi bilim adamı Serizawa ile yeniden bir araya gelir. Gojira, Tokyo'yu ve diğer Japon şehirlerini tehdit ederken ordu etkisiz kalırken Emiko, Ogata'ya güvenir. Birlikte, Serizawa'yı, Gojira'nın saldırısını durdurmak için son çare olarak Oksijen Yok Edici'yi konuşlandırmaya ikna etmeye çalışırlar.
